تأسست الجمعية كمكتب عام 1994م ثم بفضل الله توسع نشاط الجمعية وطموح القائمين عليها أعتمد المكتب كفرع للجمعية بوادي حضرموت عام 1999م من قبل مكتب وزارة الشؤون الاجتماعية والعمل بوادي حضرموت تصريح رقم ( 79/ 1999م ) .. و للفرع هيئة إدارية يتم انتخابها من الهيئة العمومية كل ثلاث سنوات .
 احتضنت الجمعية خلال مسيرتها التعليمية القرآنية المباركة عدد من الحلقات القرآنية والمراكز النموذجية وآتت ثمارها بإذن ربها حيث بلغ عدد الحفاظ والحافظات (703)  حافظ وحافظة (15) منهم حصلوا على الإجازة بالسند المتصل إلى رسول الله صلى الله عليه وسلم حتى عام 1429هـ .
 كما تم افتتاح فرع الكلية العليا للقرآن الكريم قسم البنات بوادي حضرموت عام 1424هـ حيث تخرج منه (95) طالبه على ثلاث دفعات يحملن شهادة البكالوريوس في القرآن وعلومه  .
كما أن الجمعية ترعى العديد من الدورات التدريبية والتأهيلية لمعلمي القرآن الكريم وكذا توزيع المصحف الشريف ..
ولما تقدمه الجمعية من أعمال متميزة في خدمة القرآن الكريم نالت  الجمعية الخيرية لتعليم القرآن الكريم ـ اليمن جائزة أفضل مؤسسة لخدمة القرآن الكريم عالمياً في عام 1428هـ من قبل الهيئة العالمية لتحفيظ القرآن الكريم.